La section de Madagascar présente l'ensemble de bâtiments suivant :
• La Maison Royale Malgache, copie agrandie et stylisée de la case du roi Andrianampoïnimérina, qui présente le résultat de la colonisation de l'île depuis 1895.
• La Tour des Bucrânes, symbole de la richesse de Madagascar. Cette tour de plus de 50 mètres supporte 4 têtes de boeufs de 14 mètres de haut.
• L'Atelier des Arts Appliqués, qui présente l'artisanat de l'île.
• Le portique des Comores, réplique de celui de Moroni.
• Le théâtre Malgache
5 pirogues originaires de Nossi-Bé sont présentées sur le lac.